奥塔哥大学有全新西兰第一所医学院,并且是南岛的医学研究中心,由於是第一个将试管婴儿付诸实际的医学中心,因此在世界上享有盛名。奥塔哥大学也有全新西兰唯一的牙医学校,其国际排名更是在前十名内,且为
大洋洲第一名,此外,学校也是南岛唯一设有药学,理疗,医学实验等科系的学校。这所医学院至今依旧闻名,其入学的要求与一般大学相同,第一年所有学生都要学习必修科目,然後依成绩决定往後的专业科系。学校其他非医学科系,如生理,解剖等也是世界有名的,新兴科系如生化,基因工程,或者是基础科学如物理、化学、数学等也都有开课,另外还有商学和法学等科目。尤其是商学院,和
奥克兰大学的商学院一样闻名于新西兰,每年都有百多位国际留学生,来此地取得奥塔哥大学MBA的学位。