每年注入大西洋的水量约6600立方千米,相当于世界河流注入
大洋总水量的1/6.上游从源地到马拉尼翁河口长约2560千米,分上、下两段。上段即阿普里马克河段,长约960千米。从海拔5200米的奇尔卡雪山流下,穿行于东、西科迪勒拉山脉之间的狭长高原上,河流深切,形成一系列急流瀑布。在库斯科以西130千米,穿阿普里马克峡谷出东科迪勒拉山脉,沿坡麓下行,至阿塔拉亚,与同出秘鲁南部安第斯山区的乌鲁班巴河汇合。下段即乌卡亚利河,长1600千米。向北流出80千米,进入亚马孙平原。河宽由400米展至1200米,河床比降锐减至0.047‰。至瑙塔附近,与源于秘鲁西部西科迪勒拉山脉东坡的马拉尼翁河汇合,河面宽2000米,水量激增。