东关清真大寺始建于公元1380年左右的明洪武年间，在
青海省内规模最大，历史悠久，与
西北地区著名的
西安化觉寺、
兰州桥门寺、
新疆喀什艾提卡尔清真寺并称为
西北四大清真寺。据现存寺内的《重建
西宁大寺碑记》（1914年5月立）和《重建
西宁东关大寺碑记》（1948年8月立）两块碑文记载，可以看出这座大寺已经具有600多年的历史。它是一座融塔、墙、殿为一体的伊斯兰建筑，正中的礼拜大殿为全寺最大的建筑物,占地1102平方米。整个建筑式样别致，结构分明，每逢礼拜、三大宗教节日，数以万计的穆斯林汇集在此举行隆重的聚礼活动。东关清真大寺是伊斯兰经学研究的最高学府，在海内外享有盛誉。
东关清真大寺是西宁市一座规模最大，保存最为完整的古代建筑。是青海省目前最大的伊斯兰教寺院，也是西北地区四大清真寺之一。 该寺坐落在西宁市东关大街，洪武年间，明太祖朱元璋分封铺佐他开国有功的回族将领沐英为西平侯，镇守今甘青地区。当时明王朝通过屯兵、移民等一系列实边措施，居住西宁的穆斯林居民日渐增多。为了适应广大穆斯林宗教生活的需要，沐英应回族上层及宗教人士的请求，并奏请朝廷允准，在回族聚居的东关地区动工修建清真寺。不久，一座占地面积达28000平方米，修有2000余平方米的大殿，两个宣礼塔、一座碑亭院及一些辅助建筑物的清真大寺，在今西宁东关大街拔地而起。
至清咸丰、同治年间，西宁等地的回族先后加入到全国反清大起义的行列之中，西宁遂成为这一带回族撒拉族起义军的大本营。同治十二年，左宗棠率军队进行镇压，东关大寺及所藏石碑、圣旨等文物均毁于一旦。光绪二十一年（公元1895年），河湟地区又发生了震惊清王朝的“河湟事件”，西宁东关清真大寺的命运正如《碑记》所言：“屡经兵燹，其地遂废”，“后来屡议兴复，卒以不得地基而止”。
辛亥革命以后，
甘肃河州（今
临夏）的马麒任甘边宁海镇守使。他到任不久即于民国2年5月，亲自“捐资为倡”，募集
白银万两，重新在被毁的废墟上动工修建清真大寺。一年后，一座初具规模的大寺又告建成，计建有：大殿5间，宣礼塔3层，东厅5间，北厅9间，南厅浴室3间，寺门3间，还有厨房，餐厅等。
西宁东关清真大寺占地总面积为13602平方米，建筑物雄伟壮观，具有中国古老的建筑艺术和伊斯兰教特色。大寺的原正门，即“前三门”，座南朝北，是一大两小的绿色西式大门，高十米，宽为十五米，门顶横幅匾额上镶有金光闪闪的“西宁东关清真大寺”八个大字（前三门现处在清真大寺临街楼房之前）。
该寺已有500多年的历史。 该寺正中是可以容纳3000人进行礼拜的大殿，面积约1102平方米。大殿上装饰有金光灿灿的藏式馏金宝瓶。据说，这只宝瓶是大殿修成后，由甘肃拉卜楞寺的僧众集资捐送的，为国内清真寺所仅有。大殿内的几根巨大的柱子，则是由互助佑宁寺从寺院的松树林中挑选赠送的。此大殿为中国古代宫殿式建筑，纯系砖木结构。建筑坚固，结构严谨，外形宏伟壮观，内部清静素雅。大殿南北两侧是两座两层的厢楼，为歇山式建筑。大殿和厢楼紧相毗邻，浑为一体，十分协调。这三座建筑是该寺主体，也是寺内的精华所在。整个建筑飞檐斗拱，雕梁画栋，描金涂彩，显得艳丽华贵，蔚为壮观。 大殿前和厢楼之间是一块占地约2.8万平方米的广场。场内铺着青石板，石板虽大小不一，形状各异，但却巧排密布，平整如镜，不露泥土。因此，晴天无尘埃，雨天无泥泞。
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